Genomik Sıralama Nedir?
Genomik Dizilemenin ne olduğunu anlamak için öncelikle Covid-19 ile ne yaptıklarını anlamalıyız. Onlar "Yeni bir hastalığı" olduğu düşünülen 49 kişiden 1 hastadan 1 numune aldı ve test yapılmadı.
Bu hastanın filtrelenmemiş akciğer sıvısı örneğini aldılar ve örnekten mevcut tüm RNA parçalarını çıkardılar. Numuneyi hizalama işlemine hazırlamak için sadece kısa RNA parçaları kullanıldı.
Diğer tüm RNA parçaları çıkarıldı. RNA, her zincir için bir tane olmak üzere iki adımda ters transkripsiyon yoluyla cDNA'ya dönüştürülür. Daha sonra cDNA, kısa, 75-150 baz çifti, okumalar veren yüksek verimli kütle tandem dizilemesinden önce PCR ile amplifiye edilir. Daha sonra cDNA'yı genomik dizi programlarına, Megahit ve Trinity'ye girerler.
